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蘇州阿爾法生物實(shí)驗(yàn)器材有限公司

16年專注生物實(shí)驗(yàn)室儀器設(shè)備&耗材綜合供應(yīng)

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阿爾法累計(jì)贏得1000+企業(yè)的信賴和認(rèn)可
PCR實(shí)驗(yàn)步驟
作者: 蘇州阿爾法生物 編輯: PCR儀多少錢一臺(tái) 來源: 朗基 發(fā)布日期: 2023.09.11
信息摘要:
 DNA聚合酶是實(shí)驗(yàn)室中常用的生物學(xué)酶之一,在PCR實(shí)驗(yàn)中具有重要的作用。實(shí)驗(yàn)室常用的DNA聚合酶,包括Taq聚合酶、Pfu聚合酶和Tth聚…


 DNA聚合酶是實(shí)驗(yàn)室中常用的生物學(xué)酶之一,PCR實(shí)驗(yàn)中具有重要的作用。實(shí)驗(yàn)室常用的DNA聚合酶,包括Taq聚合酶、Pfu聚合酶和Tth聚合酶。

一、Taq聚合酶:

Taq聚合酶是由Thermus aquaticus細(xì)菌產(chǎn)生的一種DNA聚合酶,在分子生物學(xué)研究中得到廣泛應(yīng)用。Taq聚合酶具有熱穩(wěn)定性,可以在高溫條件下保持活性,這是由于其來源于熱液生物,能夠存活和正?;顒?dòng)于高溫環(huán)境。這使得Taq聚合酶在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)中起到關(guān)鍵的作用。Taq聚合酶能夠按照DNA模板合成新的DNA鏈,因此在PCR中用于擴(kuò)增目標(biāo)DNA片段。然而,Taq聚合酶缺乏3'-5'外切酶活性,導(dǎo)致其生成的PCR產(chǎn)物末端容易出現(xiàn)額外的腺嘌呤堿基。因此,在某些應(yīng)用中,需要使用具有外切酶活性的聚合酶。

二、Pfu聚合酶:

Pfu聚合酶是由Pyrococcus furiosus細(xì)菌產(chǎn)生的一種DNA聚合酶。與Taq聚合酶相比,Pfu聚合酶具有更高的熱穩(wěn)定性和耐酶性。這使得Pfu聚合酶在高溫PCR反應(yīng)中表現(xiàn)出色,其高度穩(wěn)定的酶活性能夠確保PCR反應(yīng)的可靠性和準(zhǔn)確性。此外,Pfu聚合酶還具有3'-5'外切酶活性,可以修復(fù)并糾正PCR反應(yīng)中的腺嘌呤堿基誤配,有效防止誤差累積。因此,Pfu聚合酶適用于需要高度準(zhǔn)確的PCR擴(kuò)增和DNA測(cè)序。

三、Tth聚合酶:

Tth聚合酶是由Thermus thermophilus HB8細(xì)菌產(chǎn)生的一種DNA聚合酶。與Taq聚合酶和Pfu聚合酶不同,Tth聚合酶具有熱活性反轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)錄酶活性,可以將RNA模板合成相應(yīng)的DNA鏈。因此,Tth聚合酶在逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)中得到廣泛應(yīng)用,用于將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA,并通過增加熱活性酶來實(shí)現(xiàn)PCR擴(kuò)增。此外,Tth聚合酶還具有一定的外切酶活性,可用于修復(fù)和校正PCR產(chǎn)物的末端。

     這三種酶的主要區(qū)別在于:Taq聚合酶適用于普通PCR擴(kuò)增;Pfu聚合酶適用于需要高準(zhǔn)確性的PCR擴(kuò)增和DNA測(cè)序;Tth聚合酶適用于逆轉(zhuǎn)錄PCR。根據(jù)實(shí)驗(yàn)的目的和需求,選用適當(dāng)?shù)腄NA聚合酶有助于確保實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性。

1.   按下列組成在 PCR 反應(yīng)管中調(diào)制反應(yīng)液:

TaqTM 或 TaKaRa EXTaqTM 的配方

Reagent

Quantity, for  50μl of reaction mixt ure

10X PCR buffer  Mg2+ free

5 μ  l

 

MgCl225 mM

 TaKaRa Taq TM  3  μl

 TaKaRa  EXTaqTM  4  μl

2.5mM dNTP mix

4 μ  l

10μM Primer  上游

1 μ l

10μM Primer 下游

1 μ  l

Template DNA

1 μ  l

Taq  E XTaqDNA Polymerase

0.25 μl

Sterile deionized  water

Up to  50μl

Total

50 μl  /Sample

PCR實(shí)驗(yàn)中Pyrobest TM DNA Polymerase 的配方

Reagent

Quantity, for 50μl  of reaction mixture

10X Pyrobest buffer

 l

2.5mM dNTP mix

 l

10μM Primer 上游

 l

10μM Primer 下游

 l

Template DNA

 l

Pyrobest TM DNA Polymerase

0.25μl

Sterile deionized water

Up to 50μl

Total

50μl /Sample

① 反應(yīng)總體積根據(jù)實(shí)際情況進(jìn)行調(diào)控,可以做 20~50μl 以節(jié)約試劑;

② 將上表各成分加入到 0.2ml 或 0.5ml 滅菌的 PCR 薄壁管中;

③ 如果不用 PCR 儀的加熱蓋,在反應(yīng)混合液的上層加 30 ~50μl   的礦物油防止樣品在 PCR 的過程中蒸發(fā);

2.   按以下程序進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。

PCR實(shí)驗(yàn)中PCR 反應(yīng)條件視模板、引物等的結(jié)構(gòu)條件,PCR儀的不同而各異, 實(shí)際操作中需根據(jù)具體的情況以及 PCR 結(jié)果而進(jìn)行優(yōu)化。

 

Step

Temperature,

° C

 

Time, min

Number of

cycles

Note

起始變

 

94~95

 

1-3

 

1

 

變性

94~95

0.5-2

 

 

 

 

25-35

退火溫度比理論退火 溫度大概低 C  ,再

根據(jù)反應(yīng)結(jié)果優(yōu)化

 

退火

 

37-70

 

0.5-2

 

延伸

 

70-75

根據(jù)擴(kuò) 增產(chǎn)物

的大小

每分鐘延伸 1000bp

最終延

 

70-75

 

10

 

1

 

使用朗基PCR儀進(jìn)行PCR反應(yīng)實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,抽取擴(kuò)增樣品 5μl,用天能瓊脂糖凝膠電泳分析擴(kuò)增結(jié)果,用 DNA marker 判斷擴(kuò)增片段的大小或冷凍保存,以備以后分析使用。

 



蘇州阿爾法生物實(shí)驗(yàn)器材有限公司成立于2008年,位于蘇州園區(qū)生物納米園(Biobay)A5幢301室。公司管理團(tuán)隊(duì)專注于科學(xué)儀器行業(yè)十四年,擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)與完善的售后服務(wù)體系,目前已為300余家實(shí)驗(yàn)室提供優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品和服務(wù),涵蓋各大高校、檢測(cè)中心、科研機(jī)構(gòu)、制藥企業(yè)等13個(gè)群體。提供的實(shí)驗(yàn)室儀器主要包括振蕩培養(yǎng)箱,恒溫恒濕培養(yǎng)箱、二氧化碳培養(yǎng)箱、生化培養(yǎng)箱、霉菌培養(yǎng)箱、PCR儀,瑞寧移液器,生物反應(yīng)器,發(fā)酵罐,超低溫冰箱,液氮罐,高壓滅菌器,超純水機(jī),天平,離心機(jī),離心濃縮儀、研磨機(jī)、葡萄糖乳酸分析儀等。廠商企業(yè)授權(quán)包括知楚儀器、朗基、中科美菱,梅特勒,樂楓,搏旅、NEST、天根、奧盛在內(nèi)的80個(gè)余廠家。

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