影響熒光定量 PCR 儀的檢測靈敏度的因素有哪些?
一、引物和探針設計
特異性:設計的引物和探針應具有高度特異性,能準確識別目標序列。如果引物和探針與非目標序列發(fā)生結合,會產(chǎn)生非特異性擴增,降低檢測的靈敏度。例如,在檢測呼吸道合胞病毒的研究中,根據(jù)復合探針技術原理,以其 F 蛋白基因作為基因靶序列建立檢測方法,對引物與探針進行優(yōu)化與篩選,提高了檢測的靈敏度。
結合效率:引物和探針與目標序列的結合效率也會影響靈敏度。結合效率高,能夠更有效地啟動 PCR 反應,從而提高檢測靈敏度。
二、反應體系
酶的活性:PCR 反應中使用的聚合酶活性對靈敏度有重要影響。高活性的聚合酶能夠更高效地催化 DNA 合成,提高擴增效率,進而提高檢測靈敏度。
dNTP 濃度:合適的 dNTP(脫氧核糖核苷三磷酸)濃度是保證 PCR 反應正常進行的關鍵之一。濃度過高可能導致非特異性擴增增加,濃度過低則會影響擴增效率,降低檢測靈敏度。
鎂離子濃度:鎂離子在 PCR 反應中起到重要作用,它能影響聚合酶的活性和穩(wěn)定性。合適的鎂離子濃度可以提高聚合酶的活性,從而提高檢測靈敏度。但鎂離子濃度過高或過低都會影響 PCR 反應的效率和特異性。
三、儀器性能
熒光檢測系統(tǒng):熒光定量 PCR 儀的熒光檢測系統(tǒng)的性能直接影響檢測靈敏度。高靈敏度的熒光檢測系統(tǒng)能夠更準確地檢測到微弱的熒光信號,從而提高檢測靈敏度。例如,朗基實時熒光定量 PCR 儀(如 Q2000B、Q1000+)在熒光檢測靈敏度、溫度控制精度、操作便捷性等方面優(yōu)于 ABI 7500,尤其適合對成本敏感、需高通量或低拷貝檢測的實驗室。
溫度控制精度:精確的溫度控制對于 PCR 反應的穩(wěn)定性和重復性較為重要。溫度控制精度高的儀器能夠更好地保證 PCR 反應的特異性和效率,從而提高檢測靈敏度。
Q2000熒光定量PCR儀采用半導體芯片技術:升溫速率高達 6-7℃/ 秒,控溫精度≤±0.1℃,溫度均勻性更好。
雙通道同步檢測:減少延時誤差,縮短實驗時間。
多通道擴展:支持至多 21 個通道。
單機運行與斷電保護:支持觸控屏操作,實驗數(shù)據(jù)安全。
四、樣本質(zhì)量
核酸提取方法:高效的核酸提取方法能夠獲得高質(zhì)量的核酸樣本,減少雜質(zhì)的干擾,提高檢測靈敏度。如果核酸提取過程中存在雜質(zhì),可能會抑制 PCR 反應,降低檢測靈敏度。
樣本中的抑制物:樣本中可能存在的抑制物,如血液中的血紅蛋白、土壤中的腐殖質(zhì)等,會抑制 PCR 反應,降低檢測靈敏度。在檢測不同類型的樣本時,需要考慮樣本中可能存在的抑制物,并采取相應的措施去除或減少抑制物的影響。
所以,熒光定量 PCR 儀的檢測靈敏度受引物和探針設計、反應體系、儀器性能和樣本質(zhì)量等多種因素影響。在實際應用中,需要綜合考慮這些因素,優(yōu)化實驗條件,以提高檢測靈敏度。
蘇州阿爾法生物提供實驗室儀器設備主要有PCR儀、實時熒光定量PCR儀等。
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本文標簽: 實時熒光定量pcr儀 7500熒光定量pcr儀 實驗室儀器
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